Một khác biệt nhỏ nữa ở series 6 và SE là chip. SE vẫn dùng chip S5 đời cũ giống series 5 trong khi series 6 dùng chip S6, hỗ trợ thêm chip định vị U1 như ở iPhone 11. Dù vậy, tốc độ khi thao tác cảm ứng, nhận diện lệnh từ Siri thì như nhau. Cả hai đều có thời gian dùng pin 18 giờ.
Nhìn chung, Watch SE không có nhiều thiếu hụt đáng kể so với series 6 dù giá rẻ hơn gần 3 triệu đồng. Lợi thế của series 6 là vỏ nhôm 5 màu sắc, có lựa chọn vỏ thép và titan trong khi đàn em chỉ có vỏ nhôm ba màu. Tuy nhiên, theo cửa hàng ShopDunk, các bản vỏ nhôm màu xanh và đỏ của series 6 vẫn còn rất hiếm và chưa có hàng ở Việt Nam trong đợt đầu.